La tarea principal que lleva a cabo el transitario especializado en carga perecerdera, es el tratamiento adecuado de la misma. El transporte aéreo de productos que necesiten mantener una temperatura concreta, tiene un alto riesgo debido a la cantidad de puntos peligrosos que hay a lo largo de la cadena logística y que pueden amenazar la cadena de frío. Desde la carga en origen, la espera de la carga en pista, la cual puede verse afectada por las condiciones climatológicas, el tiempo en bodega (donde puede estar desde -18ºC a +20ºC), o el tiempo de espera en un almacén, son ejemplos de las fuertes amenazas externas que recibe el producto.

Es muy importante planificar, calculando el tiempo de vuelo y también, los tiempos de espera en los trasbordos, los cut-off antes de cada vuelo, los tiempos necesarios para despacho, etc.